命名、进化和家谱

整个真核生物门中发现的多种肌球蛋白基因根据发现时的不同方案命名。因此，在尝试比较生物体内和生物体之间的肌球蛋白蛋白的功能时，该命名法可能会有些混乱。

骨骼肌肌球蛋白是肌球蛋白超家族中最显着的一种，由于其肌纤维丰富，是最早被发现的。该蛋白质构成肌节的一部分，并形成由多个肌球蛋白亚基组成的大分子丝。在心肌，平滑肌和非肌肉细胞中发现了类似的形成细丝的肌球蛋白。然而，从1970年xxx始，研究人员开始在简单的真核生物中发现新的肌球蛋白基因，该蛋白编码充当单体的蛋白质，因此被称为I类肌球蛋白。这些新的肌球蛋白统称为“非常规肌球蛋白”。并且已经发现在肌肉以外的许多组织中。这些新的超家族成员已根据从其头部域的氨基酸序列比较得出的系统发育关系进行了分组，每个类别均分配有罗马数字 。非常规的肌球蛋白也具有发散的尾部结构域，表明独特的功能。从一个祖先进化可能肌球蛋白的现在多样化的前体。

对不同肌球蛋白氨基酸序列的分析表明，尾部结构域之间存在很大的变异性，但头部结构域序列却具有很强的保守性。大概是这样，肌球蛋白可以通过它们的尾巴与大量不同的货物相互作用，而每种情况下沿着肌动蛋白丝移动的目标保持不变，因此在电机中需要相同的机械。例如，人类基因组包含40多种不同的肌球蛋白基因。

这些形状上的差异还决定了肌球蛋白可以沿着肌动蛋白丝移动的速度。ATP的水解和随后的磷酸基团的释放引起“动力冲程”，其中重链的“xxx臂”或“颈部”区域被向前拖动。由于动力冲程始终将xxx臂移动相同的角度，因此xxx臂的长度决定了货物相对于肌动蛋白丝的位移。即使xxx臂承受相同的角位移，较长的xxx臂也会导致货物越走越远的距离–就像腿长的人在每一步中都可以走得更远。